许多农民将未用完的农药和第二年要用的化肥存放在居室里，这样做对人体健康危害很大。多数农药、化肥都具有挥发性，如果长期存放在居室内，其挥发出的有害气体可使人患呼吸道疾病，也会造成孕妇体内胎儿畸形和智力发育障碍，存放家中的农药还可能被儿童误用。因此，应将化肥、农药存放在与居室隔离的房里，加固门窗，以保证人身安全和生产资料的安全。 另外，把农药化肥放到一处存放也是不可取的，同一房间内存放农药、化肥有潜在的危险性，轻者会导致农药和化肥使用效果降低，重者可造成中毒或引发火灾，甚至发生爆炸事故。
农药和化肥种类繁多，特性不同，规格复杂，容易发生化学反应和物理变化。硝酸钠等易燃、易爆化肥在高温或撞击下会发热，遇到含苯、二甲苯等易燃、易挥发的农药会发生燃烧、爆炸。
过磷酸钙、硫酸铵等酸性肥料在存放中会挥发出游离酸，使环境空气呈酸性，腐蚀农药包装，不仅会给农药保管、运输和使用带来困难，而且会增加人畜中毒的危险性。
氮素化肥受热后会产生氨气，氨被潮湿空气吸收可变成碱性物质氢氧化钠，使怕碱性农药，特别是粉剂农药加速分解或聚结成团块，导致杀虫效果降低。
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